เครื่องอ่านบาร์โค้ด อาจมีข้อจำกัดในการทำงาน ถ้าคุณนำ เครื่องอ่านบาร์โค้ด ไปใช้งานในสภาพแวดล้อมที่เปียกชื้น คลื่นแสงที่ใช้ในการอ่านรหัสบาร์โค้ดจะถูกหักเหได้ง่าย เมื่อแถบบาร์โค้ดมีการเปียกชื้นก็จะทำให้การอ่านข้อมูลในแถบบาร์โค้ดเกิดการผิดพลาดได้ และในขณะที่ เครื่องอ่านบาร์โค้ด กำลังอ่านแถบบาร์โค้ดนั้น จะต้องให้เห็นแถบบาร์โค้ดอย่างครบถ้วนชัดเจน หากแถบบาร์โค้ดถูกปิดบัง เห็นได้ไม่ชัดหรือเต็มแถบบาร์โค้ด เครื่องอ่านบาร์โค้ด ก็จะไม่สามารถที่จะอ่านข้อมูลได้ อีกข้อหนึ่งซึ่งผู้ใช้งาน เครื่องอ่านบาร์โค้ด ควรทำความเข้าใจก็คือ เครื่องอ่านบาร์โค้ด ไม่สามารถที่จะอ่านแถบบาร์โค้ดที่เคลื่อนไหวด้วยความรวดเร็วได้
ดังนั้นหากแถบบาร์โค้ดติดอยู่บนวัตถุที่เคลื่อนไหวด้วยความรวดเร็วสูง จะส่งผลทำให้ความแม่นยำในการอ่านข้อมูลต่ำลง หรืออ่านข้อมูลไม่ได้เลย อย่างที่เราเห็นกันในซูเปอร์มาร์เก็ตเวลาแคชเชียร์รับชำระค่าสินค้า ก็จะต้องให้เวลา เครื่องอ่านบาร์โค้ด ได้ทำการอ่านข้อมูลอย่างชัดเจนด้วยการจ่อรหัสชัดๆ ไปที่เครื่องอ่านบาร์โค้ด และรอสักอึดใจให้ระบบได้ทำการอ่านข้อมูลนั่นเอง